Historia Kanon, której akcja rozgrywa się w środku zimy, dotyczy grupy pięciu dziewczyn, które są połączone z tym samym chłopcem. Yuichi Aizawa, główny bohater, odwiedził miasto, w którym rozgrywa się akcja siedem lat przed rozpoczęciem opowieści.
Na początku Yuichi jest bardzo oderwany od miasta i jego mieszkańców. Przed jego powrotem postanowiono, że ma zostać ze swoją kuzynką Nayuki Minase i jej matką Akiko. Po swojej długiej nieobecności Yuichi zapomniał prawie wszystko, z wyjątkiem drobnych szczegółów tego, co wydarzyło się siedem lat wcześniej i potrzebuje przypomnienia o tym, co pozostawił.
Dzień po powrocie Yuichi wychodzi z Nayuki, która oprowadza go po mieście. Nayuki przypomina sobie, że musi kupić rzeczy na obiad, a Yuichi niechętnie idzie z nią, argumentując, że może się zgubić. Chwilę po tym, jak Nayuki zostawił go czekającego na chodniku, dziwna dziewczyna o imieniu Ayu Tsukimiya wpada na niego bez ostrzeżenia. Po wyzdrowieniu ciągnie go do pobliskiej kawiarni i przyznaje się do nieumyślnej kradzieży torby wypełnionej taiyaki po tym, jak została przypadkowo wystraszona przez sprzedawcę, zanim zdążyła zapłacić. Yuichi następnie ciągnie Ayu z powrotem do sprzedawcy, obaj przepraszają za kłopoty, a Ayu zostaje wybaczona. Postanawiają spotkać się ponownie innego dnia, a Ayu ucieka.
Yuichi początkowo nie jest tego świadomy, ale trzy inne dziewczyny, o których zapomniał, są mu znajome. W całej historii, gdy dowiaduje się o nadprzyrodzonym zabarwieniu miasta, Yuichi przypomina sobie każdą dziewczynę i wydarzenia sprzed siedmiu lat w mieście pokrytym śniegiem.
