Ogromna anomalia spustoszyła kontynentalną część Japonii i zrujnowała większość Tokio, zatapiając trzy czwarte miasta w oceanie.
Dziesięć lat później narracja przenosi się do Ganty Igarashi, pozornie przeciętnego ucznia uczęszczającego do gimnazjum w prefekturze Nagano. Jako uciekinier, który przeżył fantastyczne trzęsienie ziemi, Ganta prowadził normalne życie i nie pamięta katastrofy. Wszystko się zmienia, gdy przez okna jego klasy przepływa dziwny mężczyzna w rubinowej zbroi i krwi. Uśmiechając się szaleńczo, „Czerwony Człowiek” masakruje całą klasę Ganty, ale zamiast go zabić, osadza czerwonawy kryształowy odłamek w torsie Ganty. W ciągu kilku dni od masakry Ganta zostaje skazany na śmierć w Deadman Wonderland, więzieniu, które służy również jako park rozrywki i jako oskarżony zostaje poddany jakiejś sali sądowej kangura.
Przybywając do więzienia, Ganta jest wyposażony w unikalny sposób, który śledzi ważne wskaźniki i jego miejsce. Śmiertelna toksyna jest stale wstrzykiwana do jego krwioobiegu przez chwytak, ale mimo to można ją zneutralizować, przyjmując co trzy razy określony słodki lek, co często ma się poprzez różne działania w więzieniu, np. Występy dla tłumów , działając za kulisami, kupując za sfałszowane czynniki (rodzaj pieniędzy wśród więźniów w Deadman Wonderland) itp. Aby zgromadzić Cast Points, przestępca musi wykonać śmiertelne gry w placówce i przeżyć. Na szczęście dla Ganty pomaga mu tajemnicza kobieta o imieniu Shiro, która pozornie rozumie Gantę i jest rozumiana przez innych więźniów.
Chcąc żyć jako przestępca w celi śmierci, Ganta zamierza zlokalizować „Czerwonego Człowieka”, aby oczyścić swój tytuł. W dziwnym zwrocie Ganta zaczyna nabywać zdolność kontrolowania swojej krwi, czyniąc z niej broń dla pomysłu. Nieznany Gancie, stał się jednym z więziennych „umarłych”, odizolowana liczba więźniów ma Gałęzie Grzechu, dzięki którym są w stanie kontrolować swoją krew. Ganta jest zmuszany do wzięcia udziału w okrutnych pojedynkach gladiatorów zwanych Carnival Corpse, których anonimowi widzowie płacą znaczne kwoty gotówki, aby obserwować po znalezieniu jego umiejętności. W swojej długiej walce o życie udaje mu się zaprzyjaźnić z kilkoma z tych, z którymi walczył na stadionie, i z ich pomocą Ganta kontynuuje poszukiwania, aby odkryć tożsamość „Czerwonego Człowieka”, dlaczego zmienił się w trupa, a także mroczne tajemnice skrywane przez władze penitencjarne
