Podsumowanie
Odbywa się kilka lat po pierwszej mandze Ghost In The Shell. Major zaginął od tego czasu, a Ghost in the Shell 2 podąża za tajemniczą Motoko Aramaki, która prowadzi dochodzenie w sprawie incydentu w fabryce organów i jego konsekwencji. Ucieka, aby posprzątać bałagan i uratować się w trakcie. W międzyczasie byli członkowie sekcji 9 badają Motoko, aby dowiedzieć się, kim naprawdę jest.